水平电泳槽适合哪些样品跑电泳的

一、最适合的样品类型
1. 各种 DNA 样品

这是水平电泳槽最核心的用途：

表格
样品类型 典型用途 凝胶浓度参考
PCR 产物‌ 验证扩增是否成功、判断片段大小 1%～2% 琼脂糖
酶切产物‌ 限制性内切酶消化后的 DNA 片段 0.8%～1.5%
质粒 DNA‌ 检测质粒纯度、看超螺旋/开环/线性构型 0.8%～1%
基因组 DNA‌ 提取完整性检测、纯度评估 0.6%～0.8%（低浓度胶）
DNA Marker / Ladder‌ 作为分子量标准，估算样品大小 —
cDNA‌ 反转录产物检测 1%～2%
DNA 回收纯化‌ 切胶回收目的条带 根据片段大小选择
2. RNA 样品

需在‌无 RNase 环境‌下进行，常用变性琼脂糖凝胶：

总 RNA 完整性检测（看 28S/18S 条带比例）
mRNA 大小分布分析
Northern 杂交的第一步分离
变性胶常用：甲醛变性胶、MOPS 缓冲体系
3. 寡核苷酸 / 小片段核酸
引物、探针等短链核酸的质量检测
需用‌高浓度琼脂糖‌（3%～4%）或聚丙烯酰胺凝胶（但小胶可用水平槽跑）
小片段（<100bp）分辨率有限，更小的推荐用垂直 PAGE
二、可兼顾但不是首选的样品
小分子蛋白（特殊情况）
某些‌琼脂糖凝胶电泳‌可用于分离大分子蛋白复合物（如脂蛋白、血红蛋白），但非常少见
常规蛋白样品（如 SDS-PAGE）应使用‌垂直电泳槽‌，不建议用水平槽替代
三、绝对不适合水平电泳槽的样品
常规 SDS-PAGE 蛋白电泳‌——必须用垂直板电泳（不连续缓冲体系、需要浓缩胶）
蛋白质双向电泳（2-DE）‌——专用设备
毛细管电泳‌——专用毛细管设备
脉冲场电泳（PFGE）‌——虽然也是水平槽原理，但需要专用的脉冲场电泳仪（普通水平槽不能产生交变电场），用于分离超大片段 DNA（>50kb，如染色体、BAC 文库）
四、为什么核酸适合用水平电泳？
琼脂糖凝胶制备简单‌——加热融化后浇胶，冷却即可用，无需聚合等待
水平浸没式电泳‌——凝胶完全浸在缓冲液中，散热均匀，适合较长时间跑胶
核酸带负电‌——在 pH 中性的缓冲液中向正极迁移，直接按分子量大小分离
凝胶浓度可调范围大‌——0.3%～4%，分离范围从几百 bp 到几十万 bp 都能覆盖
回收方便‌——切胶后用试剂盒即可回收纯化目的 DNA 片段
五、快速选择指南
表格
你要跑的样品 选哪种电泳槽
DNA / RNA / 质粒 / PCR 产物 ✅ ‌水平电泳槽‌（琼脂糖）
蛋白（SDS-PAGE、Western blot 制胶） ❌ 用垂直电泳槽
超大 DNA 片段（染色体、100kb+） ❌ 用脉冲场电泳仪
回收 DNA 片段 ✅ 水平电泳槽（切胶回收）
快速核酸检测（菌落 PCR、提质粒快检） ✅ 水平电泳槽（小胶 + 快速跑）