1. 将制胶架放在一个水平的桌面上，然后将凝胶托盘放到制胶架中相应的格子里，之后再 放梳子于狭槽里。根据需要，制胶架可以制作 13×13cm, 13×6.5cm，6.5×13cm, 6.5×6.5cm 四 种规格的凝胶。 2.根据被分离 DNA 片段的大小用电泳缓冲液配制适宜浓度琼脂糖溶液：应准确称量琼脂糖 干粉将其加入到盛有已定量电泳缓冲液的三角烧瓶或玻璃瓶中，用玻璃棒搅拌均匀后放入沸水 浴或微波炉中加热至琼脂糖熔化。（琼脂糖凝胶浓度选择见附表） 3.待凝胶稍微冷却后，缓慢倒入凝胶托盘中，胶厚度以 3～5mm 为宜（注意：胶内不能有 气泡）。 4.让凝胶溶液完全凝结，室温下 30～45min（待胶略凝结时，也可以放入 4℃冰箱，可大大 缩短凝结时间）。小心拔出梳子，将凝胶安放到电泳槽内，加样孔一侧靠近阴极(黑色末端)。 5.向电泳槽内加入电泳缓冲液，至少没过凝胶 2mm。（注意：TAE 缓冲液，一般用 2～3 次就要更换，TBE 缓冲液则可使用 10 次左右。） 6.取适量的 DNA 样品与 10×加样缓冲液混合(分析单一 DNA 样品，如 L 噬菌体或质粒 DNA，每个 5mm 宽加样孔可加 100～500ng DNA。如果样品由不同大小的许多 DNA 片段组成， 如哺乳动物 DNA 酶切样品，则每个加样孔加入 20～30μg 的 DNA 也不会造成分辨率明显下 降)，然后用移液枪将样品加入样品孔内。一定要包含合适的 DNA 分子量标准物，将其分别加 至样品孔的左侧和右侧孔中。 7.加样完毕后，盖上电泳槽上盖，连接电泳仪电源。给予 5～8V/cm 的电压，其中距离以 阳极至阴极之间的测量为准。阳极和阴极由于电解作用将产生气泡。DNA 应向阳极(红色插头) 侧泳动。电泳时间的选择取决于胶的长度、电压和 DNA 片段的大小。胶越长，电压越低，DNA 片段越大，所需时间就越长。然而使用高压时，大的 DNA 片段的分辨率很低，电泳出的条带 不清晰。（每厘米凝胶电压不超过 8V，若电压过高分辨率会降低，只有在低电压时，线性 DNA 分子的电泳迁移率与所用电压成正比。） 8.当指示剂迁移到凝胶底部时，关上电源并取出样品放入事先配好的 EB 溶液中染色 5～ 10min(EB 见光分解，应置于暗室中)，在紫外透射仪上观察并可用数码相机进行拍摄（也可在 制胶时将 EB 加入到凝胶中）